Anthropic usa Claude para obtener la primera estructura 3D de una partícula vault en células procariotas

El miércoles 4 de noviembre, el laboratorio de investigación en biología de Anthropic dio a conocer la primera estructura en 3D de una partícula vault obtenida en células procariotas, el grupo al que pertenecen las bacterias. Su modelo de IA, Claude, intervino en cada fase del trabajo, siempre a las órdenes del equipo.

Las vaults son enormes barriles huecos de proteína que aparecen en casi todas las células del cuerpo humano. Se descubrieron en 1986 y deben su nombre a su forma, que recordó a sus descubridores la bóveda de una catedral. Cuatro décadas después, nadie sabe todavía para qué sirven. Ya se conocían proteínas emparentadas en los genomas de bacterias y de bacteriófagos, los virus que infectan bacterias, pero según Anthropic nadie había demostrado que llegaran a formar vaults.

La que ha resuelto el equipo procede de un bacteriófago. La componen 96 copias de una sola proteína, cuando la de los mamíferos tiene 78, y es más corta y más ancha que la humana. Claude rastreó una base de datos de unos 15.000 millones de proteínas predichas, preparó el diseño del ADN de cada candidata, ayudó a poner a punto el método de aislamiento y procesó las imágenes de criomicroscopía electrónica. La purificación, que por el método habitual lleva unos tres días, se quedó en aproximadamente 90 minutos, y el primer modelo de la estructura estuvo listo en 34 horas.

Anthropic también detalla los tropiezos: un protocolo escrito por Claude retrasó el proyecto dos semanas, y al empezar el procesado se saltó un paso habitual que hubo que corregir. Los resultados están en un preprint enviado a bioRxiv. Por ahora, estas vaults solo se han producido en el laboratorio dentro de la bacteria E. coli, y su función sigue siendo una incógnita.